Studia magisterskie (studia II stopnia) w Wyższej Szkole Handlowej trwają 2 lata (4 semestry) i prowadzone są w dwóch trybach: stacjonarnym (studia dzienne) oraz niestacjonarnym (studia zaoczne). Innowacyjne programy studiów w WSH są tak zaprojektowane, aby w maksymalnie skuteczny i odpowiedzialny sposób przygotować studentów do wyzwań stawianych przez pracodawców w XXI wieku.

W roku akademickim 2011/2012 Uczelnia oferuje 3 kierunki studiów na poziomie magisterskim (w tym nowo uruchomiony EUROPEISTYKA) i 14 specjalności: